磁性微球因为具有磁性，在磁场作用下可定向运动到特定部位，或迅速从周围介质中分离出来。这些性能使其具有极广阔的应用前景，因而在细胞分离、蛋白质分离和纯化、固定化酶、免疫分析测定、靶向药物、DNA分离与核酸杂交等领域有着广泛的应用前景。
下面让我们来详细的了解一下磁性微球的应用吧
1、细胞分离
磁性微球用于细胞分离是将生物分子亲和反应的专一性和固定化生物分子易于分离的特点结合了起来。磁性微球作为不溶性载体，在其表面接上具有生物活性的吸附剂或其它配体(如抗体，荧光物质，外源凝结素等)活性物质，利用它们与细胞的特异性结合在外加磁场作用下将细胞分离，分类以及对其种类和数量分布进行研究。
2、蛋白质分离和纯化
以磁性微球为固相介质对蛋白质进行提纯是一项新兴的蛋白质分离技术。传统的蛋白质分离方法如盐析、有机溶剂、膜分离技术、离子交换技术和层析技术等，通过改变pH值、温度、离子强度、介电常数等因素来达到分离的目的，分离过程繁杂，而且目标蛋白质的损失大。
而蛋白质的磁分离是通过对磁性微球表面的改性，共价结合能被目标蛋白质识别和可逆结合的配基，然后进行目标蛋白质的分离。
在磁分离过程中，将磁性微球直接放入含有目标蛋白质的混合溶液中，目标蛋白质与磁性微球紧密结合，然后利用外部磁场进行分离。整个分离过程不需对混合溶液的pH值、温度、离子强度和介电常数进行调整，从而避免了传统分离过程中蛋白质的损失。与传统分离方法相比较，蛋白质的磁分离技术具有快速、高纯、高收率等优点。
3、固定化酶
固定化酶是通过物理的或化学的方法，将酶分子束缚在载体上，使其既保持酶的天然活性，又便于与反应液分离，可以重复使用，它是酶制剂中的一种新剂型。运用磁性高分子微球作为结合酶的载体。
4、免疫分析测定
在磁性高分子微球表面偶联定向吸附于细菌的抗体，并利用它与原液混合、沉降。在磁场作用下分离、提纯，得到吸附于磁性高分子微球上的活细菌。
磁性高分子微球可偶联抗体分离带特定抗原的免疫细胞，利用磁性高分子微球结合的抗原或抗体进行免疫分析，具有特异性高、分离快、重现性好等特点。有研究将其用在糖尿病的临床免疫分析中，并取得了良好的分析结果，表明这种非放射性磁性酶联免疫测定技术已趋成熟。
5、靶向药物
为了提高药物的效用，减少副作用，靶向药物正成为当今的热门课题，所谓生物技术就是利用药物载体的pH敏、热敏和磁性等特点在外部环境的作用下对病变组织实行定向给药。通过对磁性微球表面的功能化，作为药物载体，在外加磁场的作用下，将药物载至预定区域，实现靶向给药技术。
6、DNA的分离与核酸杂交
磁性微球还可用于分子生物学，用来分离纯化键合有蛋白质的DNA和RNA。偶合DNA碎片的磁性微球可以用作DNA探针或者序列反应模板
