健竹科技测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品
- 产品型号：360007
- 更新时间：2020-06-11
- 产品介绍：测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品【批号】360007-201401【性状】无色液体
- 厂商性质：经销商
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产品介绍
测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品
测序仪性能评价用脱氧核糖核酸参考品
【用途】包括四种基因组 DNA 样本，分别是人基因组 DNA 样本、大肠杆菌基因组DNA 样本、高 GC 菌基因组DNA 样本、HPV 病毒基因组DNA 样本。用于一代、二代测序仪测序准确度、重复性等性能评价。
编号 | 名称 | DNA 来源 | 细胞或菌种 来源 |
1 | 人全基因组DNA | 炎黄细胞系 | 正常男性外周血白细胞构建永生细 胞系 |
2 | 大肠杆菌基 因组 DNA | DH5α感受态 培养细胞 | 商业购买 |
3 | 高 GC 含量细菌基因组 DNA | 高 GC 菌培养物 | 人肠道中分离筛选鉴定后培养厌氧 菌 |
4 | 11 型 HPV 基 因组 DNA | 11 型HPV 病毒 重组质粒 | 中检院制备 国家标准品 |
【包装】1.5mL 螺口冻存管
【规格】共计 36 支参考品样本，每支参考品装量 50μl。YH 正常人基因组 50ng/μL、YH 正常人基因组 25ng/μL、YH 正常人基因组12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高GC 含Olsenella 细菌基因组 25ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因组 12.5ng/μL、大肠杆菌DH5ａ细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5 ａ细菌基因组 25ng/μL、大肠杆菌DH5ａ细菌基因组 12.5ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL 各三支。
【使用方法和要求】
1. 测序通量≥10Gb/run 二代测序仪评价：YH 正常人基因组 50ng/μ L、YH 正常人基因组 25ng/μL、YH 正常人基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因组 25ng/μL、大肠杆菌DH5ａ细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5 ａ细菌基因组 25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 25ng/μL 各取 40μl 直接进行打断建库；人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 12.5ng/μL、大肠杆菌 DH5ａ细菌基因组 12.5ng/μL 应采用TE 稀释 5 倍后各取 40μl 进行打断建库。
本参考品使用时，应满足：
测序准确性：针对人基因组 DNA 参考品使用 2ug、1ug 和 500ng 起始，人基因组DNA 参考序列中 1G 参考序列测序比对，测序准确度应不低于 99.0%；针对细菌和病毒DNA 参考品使用 2ug、1ug 和100ng对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对，测序准确度应不低于99.0%。
重复性：进行三次重复测序，要求测序准确性均能满足对人基因组DNA参考序列中1G参考序列测序比对，测序准确度应不低于99.0%； 对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对，测序准确度应不低于99.0%。
测序通量<10Gb/run 二代测序仪评价：YH 正常人基因组 50ng/μL、 YH 正常人基因组 25ng/μL、YH 正常人基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组 50ng/μL、高 GC 含量Olsenella 细菌基因组 25ng/μL、大肠杆菌DH5ａ细菌基因组 50ng/μL 大肠杆菌DH5ａ 细菌基因组 25ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 50ng/μL、人乳头瘤病毒 11 型基因组 25ng/μL 各取 40μl 直接进行打断建库；人乳头瘤病毒 11 型基因组 12.5ng/μL、高GC 含量Olsenella 细菌基因组12.5ng/μL、大肠杆菌 DH5ａ细菌基因组 12.5ng/μL 应采用 TE 稀释5 倍后各取 40μl 进行打断建库。
本参考品使用时，应满足：
- 测序准确性：针对人基因组 DNA 参考品使用 2ug、1ug 和 500ng 起始，人基因组DNA 参考序列中 30Mb 全外显子参考序列测序比对， 测序准确度应不低于 99.0%；针对细菌和病毒 DNA 参考品使用 2ug、1ug和 100ng 对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高 GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对，测序准确度应不低于 99.0%。
- 重复性：进行三次重复测序，要求测序准确性均能满足对人基因组DNA 参考序列中 30Mb 全外显子参考序列测序比对，测序准确度应不低于 99.0%；对大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列测序比对，测序准确度应不低于 99.0%。
- 一代测序仪评价：每支参考品均直接使用或采用TE 稀释后使用。根据参考品序列设计合适的扩增引物进行扩增后，进行连续 4K 序列的测序。
本参考品使用时，应满足：
1） 测序准确性：人基因组DNA 参考序列、大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列中各 4K 连续参考序列测序比对，测序准确度应不低于99.0%。
- 重复性：进行三次重复测序，要求测序准确性均能满足人基因组DNA 参考序列、大肠杆菌基因组DNA 参考序列、高 GC 含量细菌基因组DNA 参考序列以及HPV11 型基因组DNA 参考序列中各 4K 连续参考序列测序比对，测序准确度应不低于 99.0%。
【贮藏】-70℃储存。
【注意事项】
1. PCR 操作按照分区进行，使用带滤芯的枪头吸取，防止污染。稀释时应避免剧烈震荡。
2. 应于-70℃储存，避免反复冻融。
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